Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf1Q5U4C3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf1Q5U4C3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms