Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim38Q5SZ99 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms