Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Brip1Q5SXJ3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brip1Q5SXJ3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms