Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXG7

Vmo1, Vitelline membrane outer layer protein 1 homolog, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmo1Q5SXG7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Vmo1Q5SXG7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Vmo1Q5SXG7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Vmo1Q5SXG7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Vmo1Q5SXG7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Vmo1Q5SXG7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Vmo1Q5SXG7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Vmo1Q5SXG7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Vmo1Q5SXG7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Vmo1Q5SXG7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmo1Q5SXG7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms