Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med13Q5SWW4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Med13Q5SWW4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms