Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bbs12Q5SUD9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bbs12Q5SUD9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms