Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r223Q5SSA0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r223Q5SSA0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms