Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQF8

Sap30l, Histone deacetylase complex subunit SAP30L, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30lQ5SQF8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sap30lQ5SQF8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sap30lQ5SQF8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sap30lQ5SQF8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sap30lQ5SQF8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sap30lQ5SQF8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sap30lQ5SQF8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sap30lQ5SQF8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sap30lQ5SQF8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sap30lQ5SQF8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sap30lQ5SQF8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sap30lQ5SQF8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sap30lQ5SQF8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30lQ5SQF8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30lQ5SQF8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sap30lQ5SQF8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms