Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brsk1Q5RJI5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brsk1Q5RJI5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms