Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm12253Q5NC48 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm12253Q5NC48 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm12253Q5NC48 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm12253Q5NC48 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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