Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CoblQ5NBX1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CoblQ5NBX1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms