Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ecm2Q5FW85 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ecm2Q5FW85 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms