Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc8bQ5DU41 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc8bQ5DU41 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc8bQ5DU41 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8bQ5DU41 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8bQ5DU41 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8bQ5DU41 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8bQ5DU41 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8bQ5DU41 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8bQ5DU41 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc8bQ5DU41 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms