Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sfmbt2Q5DTW2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms