Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufaf2Q59J78 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf2Q59J78 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms