Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Otol1Q4ZJM7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otol1Q4ZJM7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms