Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Carmil2Q3V3V9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Carmil2Q3V3V9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms