Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnah12Q3V0Q1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnah12Q3V0Q1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms