Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc43Q3V0L5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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