Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930567H17RikQ3V0K5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms