Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc27Q3V036 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc27Q3V036 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms