Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc160Q3UYG1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc160Q3UYG1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc160Q3UYG1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms