Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E330034G19RikQ3UWX6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E330034G19RikQ3UWX6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms