Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nr1d1Q3UV55 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nr1d1Q3UV55 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms