Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trat1Q3UU67 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms