Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chpf2Q3UU43 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chpf2Q3UU43 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms