Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
B230104I21RikQ3USW4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
B230104I21RikQ3USW4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms