Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Znf48Q3US17 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Znf48Q3US17 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Znf48Q3US17 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf48Q3US17 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Znf48Q3US17 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Znf48Q3US17 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Znf48Q3US17 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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