Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl4Q3URY0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl4Q3URY0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms