Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS9

Ccdc51, Coiled-coil domain-containing protein 51, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc51Q3URS9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc51Q3URS9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc51Q3URS9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms