Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fcho2Q3UQN2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho2Q3UQN2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms