Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cog7Q3UM29 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cog7Q3UM29 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms