Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ell2Q3UKU1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ell2Q3UKU1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ell2Q3UKU1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ell2Q3UKU1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ell2Q3UKU1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ell2Q3UKU1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ell2Q3UKU1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ell2Q3UKU1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ell2Q3UKU1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms