Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smu1Q3UKJ7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smu1Q3UKJ7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms