Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms