Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Mier3Q3UHF3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mier3Q3UHF3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms