Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pitpnm3Q3UHE1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms