Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Puf60Q3UEB3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Puf60Q3UEB3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms