Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf166Q3U9F6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf166Q3U9F6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms