Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3U7U4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q3U7U4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U7U4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms