Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hectd3Q3U487 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms