Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vars2Q3U2A8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vars2Q3U2A8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vars2Q3U2A8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms