Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc9Q3U0M1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc9Q3U0M1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms