Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700066B19RikQ3TS39 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700066B19RikQ3TS39 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700066B19RikQ3TS39 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700066B19RikQ3TS39 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700066B19RikQ3TS39 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700066B19RikQ3TS39 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms