Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc4Q3TR08 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms