Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam107bQ3TGF2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam107bQ3TGF2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms