Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem248Q3TBN1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem248Q3TBN1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms