Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VrtnQ3SYK4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VrtnQ3SYK4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms