Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr27Q3SYJ2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms