Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccbe1Q3MI99 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms